第一节、海关
海关是报关公司的主管单位,报关行依法按程序代理客户向海关申报进出口货物(很多工厂和外贸公司有自理报关权)。海关的其它基本职能还包括：监管、征税、统计、缉私。以大鹏海关为例，大鹏海关业务科包括：综合业务科、码头监管科、转关科、调查科、船管科、办公室、人保科、行政财务科。
深圳海关分一线海关和二线海关（有没有三线海关不清楚）。一线海关指申报之后直接可以出境的海关。而二线海关指申报之后必须再通过一线海关再报关才能出口的海关。
深圳海关总署共有几个一线海关：
大鹏海关、蛇口海关、文锦渡海关、皇岗海关、沙头角海关，其中蛇口海关又包括以下几个码头；SCT （SHEKOU）、赤湾（CHIWAN，赤湾码头在凯丰码头对面，现已合并为一家公司对外称赤湾）、妈湾（MAWAN ）、招港（ZHAOGANG）、东角头（进口码头）。其中中港拖车—陆路口岸：文锦渡、皇岗、沙头角

一线海关当中又分为船运和路运海关，五个一线海关当中大鹏海关和蛇口海关为船运海关，文锦渡海关、皇岗海关、沙头角海关为路运海关。
二线海关如笋岗海关、福田保税区海关等。盐田的怡和仓、文辉物流、马士基物流等保税仓直接向大鹏海关申报。湖北仓、梅园仓、603仓等海关监管仓库向笋岗海关申报。
第二节、报关所需单证
一、出口报关所需报关资料
1．一般贸易报关所需报关资料：
. 报关委托单(一式两份,盖公章)
2). 货物出口报关单(一式两份,盖报关专用章，有的货物入海关监管仓需盖公章)

存(出)仓委托书(盖公章)，整柜出口不需要存（出）仓委托书。

 装箱单(一式两份,盖公章)
 发票(一式两份,盖财务专用章或公章)
6). 销售合同正本(一式两份,盖合同专用章或公章)（注意有效期和企业代码和贸易条款，当贸易条款为CIF或C&F时，需提供买卖单价）
7). 核销单(一式一份,盖公章)
8). 其它必需的证书，如商检、动植检、许可证、配额等
 重柜纸（有的船公司需要，其中盐田一定要，蛇口有一部分船公司需要，比如MSC，但有的船公司则不需要）
2、手册报关
对于三资企业来说，如果做的是来料加工或进料加工，则用手册报关+核销单，其它所需报关资料同一般贸易。来料加工指工厂没有进出口权，接到国外客户订单加工之后再出口给国外客户，工厂不负责出口销路，来料加工只收取工缴费。来料加工出口的核销单需到外经委加盖章。进料加工的工厂可以自行出口，自己选择贸易商。
3、转关
1).转关纸(盖以发货人、车行章)，异地海关放行章。
2).出口报关单3).重柜纸（有的船公司需要，有的船公司不需要）
4).司机本(必须在起运地或指运地备案)
4、清单报关，指工厂用集中报关单出口报关，只能用在文锦渡及皇岗和沙头角。
二、进口报关:
1．一般贸易进口报关:
1).报关委托书(盖收货人章)
2).装箱单(盖发货人章)
3).发票(盖发货人章)
4).合同
5).提单(B/L)
6).提货单(D/O)
7).商检、动植检、许可证等海关所需单证
2、进口转关所需报关资料：
1).发票(发货人章)
2).装箱单(发货人章)
3).司机纸(转关纸)(发货人、收货人、车行章)
4).提单(B/L)
5).提货单（D/O）
6).司机本(大鹏海关备案)
第三节、报关操作流程：(以深圳地區海關爲例)
一、 出口报关流程
1．一般贸易
1. 查电脑舱单，即重柜有没有还场（有重柜纸，如果海关电脑里没有资料也不行）
2. 到船公司编号(如果是驳船，请向船公司确认船名)
3. 输单（必须是跟海关联网的报关行才能输单）
4. 核查核销单、船名航次等基本资料，确认无误后发送至审单中心（审单中心在总关）
5. 审单中心回执、打印报关单6. 递单报关(若查柜，则安排查验计划，由报关员工协助查验)
7. 放行(收放行单)